Se compreendi corretamente, para calcular as distâncias entre os pontos basta subtrair o destino do ponto inicial, ou seja, y - x. Independente do sinal, você vai ter a distância entre os pontos fazendo assim, a diferença é que se ponto de destino for maior que o ponto de partida o resultado é negativo, se for o inverso, o resultado é negativo. Seria como interpretar que positivo você está avançando e negativo está voltando, mas o que importa é que a distância é calculada corretamente independente do sinal. No Excel, se você desejar ter sempre o valor numérico da distância sem o sinal, basta envolver a conta na função ABS, por exemplo, =ABS(B1-A1).