Victor,

Bom Dia!

Basta você inserir a linha de código abaixo, dentro do evento Workbook_Open:

 Application.DisplayAlerts = False

Bom dia!!

Outra forma, quanto aos links

Private Sub Workbook_Open() 
    ThisWorkbook.UpdateLinks = xlUpdateLinksNever 
End Sub 

Alexandre,

UpdateLinksNever nunca atualiza os dados ou sempre atualiza quando abre? Eu preciso que ele atualize os dados com os links das outras planilhas.

Bom dia!!

Neste caso a opção dada pelo mestre Wagner Morel, é mais indicada!

Veja mais em:
http://www.java2s.com/Code/VBA-Excel-Ac ... rmacro.htm
http://www.exceltip.com/st/Turn_off_war ... l/413.html
Veja também
Fonte:
http://www.ozgrid.com/VBA/update-links.htm

Sub OpenUpdate()
    Workbooks.Open FileNmae:= _
        "C:Meus DocumentosMeuArquivo.xls", UpdateLinks:=xlUpdateLinksAlways
End Sub

Sub OpenDontUpdate()
 Workbooks.Open FileNmae:= _
       "C:Meus DocumentosMeuArquivo.xls", UpdateLinks:=xlUpdateLinksNever
End Sub



Sub OpenUpdateLinksPerSettings()
    Workbooks.Open FileNmae:= _
        "C:Meus DocumentosMeuArquivo.xls", UpdateLinks:=xlUpdateLinksUserSetting
End Sub

Att