Só postando a planilha para verificar...

regi, o ideal seria postar a rotina que está utilizando ou anexar o arquivo para analizar melhor, mas como diz que está utilizando o Evento da Worksheet, provavelmente, em alguma parte das instruções deve estar sendo utilizado a Propriedade EnableEvents, a qual desativa e ativa a execução darotina, então veja se tem as seguintes linhas :

Application.EnableEvent=False
e
Application.EnableEvent=True

O que pode estar acontecendo, dependendo do que estiver executando, a propriedade False desativa a execução da rotina continuando em background, e quando chega ao final do processamento define a mesma como True, ativando a continuação da rotina, podde ser que em determinado momento devido a algum erro o processamento pule a condição True.

Espero que seja isto, de uma olhada e retorne.

[]s